宏基因組學和宏轉錄組學整合分析
實驗介紹宏基因組測序是以特定環境中的整個微生物群落作為研究的對象，不需對微生物進行分離培養，而是提取環境微生物總DNA進行研究。采用新一代高通量測序技術對環境微生物樣品的DNA直接測序。研究微生物群體的物種分類、群落結構、系統進化、基因功能以及物種間的代謝網絡等。
宏轉錄組測序可原位研究特定生境特定時空下微生物群落中活躍菌種的組成以及活性基因的表達情況。結合理化因素的檢測，宏轉錄組可研究多樣本間由于理化等指標的差異，時空上不同微生物群落間活躍成分組成的差異分析。結合宏基因組測序，宏轉錄組測序可研究活躍菌種以及高表達基因的組成情況，揭示特定環境因子影響下菌種的適應性以及基因表達可能的相應機制。
2. 技術路線及方法：
3. 部分類似結果展示
a. 多個樣本中的表達結構：
Fig1. 5個樣本的宏轉錄組的表達結構
b. SEED subsytem注釋比較分析
Fig2. 宏轉錄組與宏基因組樣本在不同的SEED subsysterm注釋中的物種結構
3. GH家族的注釋比較分析
Fig3. 宏轉錄組與宏基因組樣本在不同的GH注釋中的物種結構
4. 宏轉錄組顯著差異功能分析
Fig4. 兩種狀態下的宏轉錄組樣本的顯著差異功能分布火山圖
5. 關鍵通路的分析
FIG5. 宏轉錄在關鍵通路中檢測到有差異表達的基因的分布比較
送樣要求：
宏轉錄組測序：RNA濃度＞150ng/μl，總量＞2.5μg，濃度以質檢結果為準，建議送2次建庫的量，即5μg。260/280在1.8-2.0之間；260/230在1.8-2.0之間。
宏基因組測序：DNA：單次建庫送樣要求：濃度＞100ng/μl，總量＞2.5μg，濃度以質檢結果為準，建議送2次建庫的量，即5μg。260/280在1.8-2.0之間；260/230在1.8-2.0之間。
